钦天监的铜漏停摆那夜,顾与卿在父亲沾着星屑的砚台下，摸到了半枚刻着“双鲤”的玉佩，这位自幼与天书为伴的钦天监遗孤，总在夜半惊醒时，看见父亲用最后力气在黄绢上画下的双鱼图腾——那图腾在火光中扭曲，像一张无声的网。
三年前,司天监正监顾玄清因“私窥天机，诅咒社稷”被赐死，尸身却于次日出现在城郊雷公庙，浑身焦黑如遭雷劈，唯有颈间玉佩不碎，顾与卿不信父亲会叛国，带着父亲留下的《周髀算经》残卷和一身观星辨卦的本事，从京城南滇一路追查，他在南滇瘴气林中遇见了用银针破解“巫蛊娃娃”奇案的九公主李令月，这位被贬出京的公主，看似不谙世事，却对药理机关了如指掌，她手中的“雷公凿”竟能引动地下磁石，破解了雷城“雷公显灵”的机关术——实则是有人用硝石硫磺伪造天罚，屠戮整个雷城矿工，只为掩盖矿脉中“双鱼图腾”的矿坑。
从南滇的蛊毒案到雷城的焚尸案,从市井流传的“鬼市画皮”到深宫秘传的“星变谶纬”，顾与卿的占卜之术与李令月的医术机关相辅相成，却总在接近真相时撞上无形的墙，直到他们在太史署的尘封档案中，发现父亲当年曾密报“双鱼”组织潜伏六部，而“双鱼”图腾，正是前朝被诛的星象师家族徽记，当顾与卿顺着线索潜入皇宫，却在养心殿外看见了父亲“复活”的身影——原来当年“雷公显灵”是宫中设局，父亲假死脱身，却成了“双鱼”挟持皇室的人质。
亲情与正义的天平在顾与卿心中倾斜：父亲是叛国者，还是潜伏的卧底？九公主的真实身份，是否也与这惊天阴谋有关？当双鱼图腾在星象台完全显现，一场颠覆王朝的阴谋即将拉开序幕，而顾与卿握紧了父亲留下的半枚玉佩——他要用自己的方式，解开这场“钦天奇谭”的最终谜题。
